Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CDK16Q00536 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CDK16Q00536 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms