Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX1P83916 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX1P83916 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX1P83916 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX1P83916 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX1P83916 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX1P83916 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms