Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRX1P78414 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRX1P78414 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRX1P78414 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRX1P78414 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRX1P78414 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms