Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTA1P68133 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTA1P68133 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms