Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACTA2P62736 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms