Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA9P57773 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA9P57773 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA9P57773 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GJA9P57773 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GJA9P57773 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms