Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GFRA1P56159 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms