Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAG2P55895 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAG2P55895 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms