Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PGGT1BP53609 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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