Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms