Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ARL1P40616 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARL1P40616 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms