Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPS1P31327 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPS1P31327 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CPS1P31327 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms