Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CD34P28906 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CD34P28906 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CD34P28906 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms