Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ACADSP16219 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ACADSP16219 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ACADSP16219 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ACADSP16219 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSP16219 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACADSP16219 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms