Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DSPP15924 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DSPP15924 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DSPP15924 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DSPP15924 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DSPP15924 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DSPP15924 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms