Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ITGAVP06756 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ITGAVP06756 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms