Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFNA4P05014 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFNA4P05014 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IFNA4P05014 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms