Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4K4O95819 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4K4O95819 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms