Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RHOBTB3O94955 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RHOBTB3O94955 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms