Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATG12O94817 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ATG12O94817 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms