Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC45O75419 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC45O75419 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms