Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP4O75379 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAMP4O75379 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms