Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD4O60885 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD4O60885 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD4O60885 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BRD4O60885 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BRD4O60885 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BRD4O60885 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BRD4O60885 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BRD4O60885 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BRD4O60885 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BRD4O60885 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms