Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SYNGR3O43761 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms