Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
DENRO43583 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DENRO43583 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DENRO43583 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DENRO43583 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DENRO43583 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms