Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

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Length 1,037 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HIP1O00291 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HIP1O00291 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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