Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01387J3KSC0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms