Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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