Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPA5E9PKD4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPA5E9PKD4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms