Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms