Protein–RNA interactions for Protein: E7EW58

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3E7EW58 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRRN3E7EW58 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms