Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVV-2B6SEH9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVV-2B6SEH9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms