Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
C9orf92A6NGG3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms