Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRP5LA4QPB2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms