Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC162PA2VCL2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms