Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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ARL2-SNX15V9GYD0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ARL2-SNX15V9GYD0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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