Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KCNIP3Q9Y2W7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms