Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHF8Q9UPP1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms