Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJD2Q9UKL4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJD2Q9UKL4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms