Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDC42EP3Q9UKI2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDC42EP3Q9UKI2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms