Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RCAN3Q9UKA8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms