Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNA9Q9UGM1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms