Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SPASTQ9UBP0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms