Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ABI3Q9P2A4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABI3Q9P2A4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms