Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZDHHC3Q9NYG2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms