Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM53CQ9NYF3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM53CQ9NYF3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms