Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GDAP2Q9NXN4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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