Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FSCN3Q9NQT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FSCN3Q9NQT6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms