Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NRIP3Q9NQ35 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms