Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SEMA4BQ9NPR2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SEMA4BQ9NPR2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms